Pēc zombiju vīrusa noplūdes Ambrela korporācijā apokalipse sākās uz vietas, bet cilvēkiem izdevās to pārvarēt Resident Evil: attīrīšanas darbība un inficēto skaits sāka samazināties. Tomēr perēkļi palika, un viens no tiem tiks izslēgts ar spēles Resident Evil varoņu varoni: tīrīšanas operāciju.